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图书馆位于海南医学院内，分布于两座建筑内：
一、图书馆北楼（科研实验楼二楼）包括： 期刊部、信息咨询部、文献检索教研室、系统部（含电子阅览室） 二、图书馆北楼（科研实验楼一楼）包括： 采编部、流通部 三、图书馆南楼（二层小楼，位于学术报告厅南侧） 图书流通部（含图书外借处、工具书阅览室、借阅办证处）、馆长办公室 四、书刊装订室（平房第3-4间）
